制药工程学硕士学位点为2024年我校申请新增目录外自主设置硕士点，同年获批，2025年开始招收学术学位硕士研究生。

学位点面向制药工业的关键科学与技术问题，将药学、中药学与工学进行有机融合开展研究工作，经过多年的凝练与发展，主要形成制药过程传质与分离、制药新技术与新方法等两个特色研究方向。近5年，承担国家自然科学基金4项，国家重点研发计划子课题4项，安徽省自然科学基金2项，安徽省高校自然科学研究项目6项，校企合作项目2项等；发表学术论文40余篇；申请发明专利30余项。

学位点现有导师10人，其中教授3人（博导2人），副教授4人，讲师1人，助理研究员2人，均为博士。团队拥有安徽省教学名师1人，安徽省教育厅优青2人，安徽省青年拔尖人才1人，全国创新创业优秀博士后1人，安徽省优秀青年研究生导师1人。学科拥有制药工程原理实验室、制药工艺学创新实验室、制药工程中试平台等实验室，建有安徽中医药大学制药工程技术研究中心、药物制剂技术与应用安徽省重点实验室等研究平台。