1993年我校获批中药学一级学科硕士点，1995年开始在中药学硕士点招收药理学培养方向的硕士研究生，在此基础上，2012年，药理学作为药学二级学科硕士点批准招生。通过整合校内药学院、中西医结合学院、科研实验中心、省中医院药学部等部门的资源，形成了一支结构合理、学风端正、团结合作和富有创新精神的学术团队。拥有2支省级教学团队，省级科技创新团队及省级优秀研究生导师团队各一支。本硕士点现有博士生导师16人，硕士生导师37人，均具有高级职称，其中正高级职称22人、副高级职称15人。

药理学硕士点主要有以下研究方向：心脑血管药理学、抗肿瘤药理学、 生殖-内分泌及代谢药理学、神经精神药理学、抗炎免疫药理等研究方向。学位点拥有整体生理学实验室、离体器官实验室、生物化学室、细胞培养室、分子药理学研究室、血液流变学研究室、动物行为学研究室、生化分析室、病理室等，配备了较为先进的仪器设备。本学位点掌握了制备多种动物模型的关键技术，构建了动物病理/病证模型研究技术平台；开展了传统方剂、有效部位或单体成分活性筛选及复方药物研究。近五年本学科先后主持国家新药创制重大专项、国家科技支撑计划、国家自然科学基金等国家级以及省部级科研项目，获得安徽省科学技术进步奖一、二、三等奖等奖项。

药理学硕士点要求研究生掌握与药理学相关的基础理论和专业知识，熟悉本学科领域的研究现状和发展趋势，掌握药理学相关的研究工作思路和方法；具有一定的撰写科研论文的能力；掌握一门外国语；具备良好的科学素养和道德品质；能胜任高等院校、科研院所、企业相关的科研和教学工作。